TG酶在食品之中有着很好的应用，它可以改善和增加加工肉制品中蛋白质的粘结力，把低价值的肉、鱼肉、虾肉的碎片结合在一起。增强肉制品的弹性，提高其切片的性能，提高产品的嫩度，还可以改进肉制品的质地结构，制作出各种各种鱼酱、汉堡、肉卷、鲨鱼鳍仿制品等，提高产品市场价值。
TG酶能够增强食品的持水性，香肠和奶酪等胶状食品经TG酶处理，可形成大量的分子间共价交联，在温度变化及机械冲击下，仍有较强的持水能力，不易脱水收缩。TG酶还可以减少食品对健康的危害，以及应用于豆制品之中，增加持水性和Q弹感。
